Situata sul lato della piazza prospiciente il Castello, fa parte del Convento delle Monache Agostiniane, elevato a Monastero di clausura nel 1652. 

La chiesa venne consacrata nel 1676; al suo interno, sulla parete sinistra, vi è il "San Francesco Saverio" di Gregorio De Ferrari, Barocche sono la struttura della chiesa, a pianta centrale, e le decorazioni. 
 
Il Monastero, con il suo meraviglioso giardino è il luogo dove le monache coltivavano erbe aromatiche, preparavano sciroppi di rosa, confezionavano funghi secchi e dolci di pasta di mandorla cavi all'interno e dalle forme "rubate" alla natura: frutti, verdura e fiori da quest'ultimi il nome "Sciuette", la cui ricetta custodita gelosamente per secoli rimane e rimarrà tra le mura del convento.

L'illustre maestro Gioacchino Rossini, fine estimatore dei funghi secchi delle Monache Agostiniane di Varese Ligure, così scrisse all'amico che gliene fece dono:

"Mi corre debito prevenirla che ieri fu rimessa alla mia casa, la tanto desiderata cassetta di funghi di Varese....
Le sono oltremodo riconoscente per la offerta gentile che Ella mi fa per l'avvenire, creda pure che occorrendo me ne prevarrò..."

"Mi sarebbe caro conoscere l'indirizzo a Varese dello stabilimento o convento, alfine di potermi rivolgere direttamente per l'acquisto dei funghi che sono oltremodo deliziosi, se Ella puol favorirmi gliene sarò riconoscentissimo". Suo Dev.mo G. ROSSINI - Parigi 12 Novembre 1867.